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一、著作：
1．《亲历“”——十四位南京师生口述历史》，美国纽约柯捷出版社，2009
2．《》（日文版），筑地出版社，2009
3．《近代中国知识分子及其政治思潮研究》，美国溪流出版社，2009
4．《遥想盛世——人治的理想与现实》，河南出版社，1998
5．《国共两关系史》（参加写作），江苏出版社，1990
二、论文：
1. Local Factionalism in the Cultural Revolution: Nanjing Under Military Control
Journal of Asian Studies , June Issue, 2011，forthcoming
2. Factions in A Bureaucratic Setting: The Origins of Cultural Revolution Conflict in Nanjing
China Journal, January Issue，2011，
3. Nanjing’s failed January Revolution of 1967: The Inner Politics of an Aborted Power Seizure
China Quarterly，September Issue，2010
4. The First Uprising of the Cultural Revolution at Nanjing University: Dynamics, Nature and Interpretation
Journal of Cold War Studies，Summer Issue，2010
5. 1957年江苏某些地区中小学反右运动初探
《中史研究》，2010年第12期
6. 对五十年代农村改造运动的再探讨
《中史研究》1997年第4期（复印转载）
7. 关于1950－60年代中国的几个问题
《当代中国史研究》1997年第2期
8. 评《剑桥史》中关于思想的研究
《思想论坛》1997年第4期（复印转载）
9. 论建国初期的国内主要
《南京学报》1995年第1期（复印转载）
10. 试论农业合作化运动中的若干失误
《南京学报》1996年第4期
11. 试论解放战争时期国共两的土地与农民政策
《江苏社会科学》1996年第4期（复印转载）
12. 试论早期农运工作中心地位之形成
《江苏社会科学》1997年第5期（复印转载）
13. 略论新理论新方法在史学研究中的应用
《江苏社会科学》2004年第1期
14. 论“问题与主义”之争前后的李大钊思想
《社会科学研究》2004年第4期（《新华文摘》摘要转载，复印转载）
15. 论1932－1935年间蒋介石个人权力的扩张
《江苏社会科学》2002年第3期（复印转载）
16. 论“评论派”陈之迈的政治思想
《江苏社会科学》2007年第1期，（复印转载）
17. 论1910-1930年代中国自由主义知识分子的发展流变
《档案》2003年第2期（复印转载）
18. 论“五四”时期高一涵的自由主义观念
《档案》2004年第4期
19. 对《南街社会》的不同看法
《中国图书评论》2005年第2期
20. 马克思主义史学理论的向度与发展空间
《中国图书评论》2006年第3期
21. 当代美国宗教现象
《读书》2000年第8期
22. 乡村中国的现代转型
《学海》2004年第6期
23. 对农业人口非农化问题的逆向思考
《开放时代》1997年8月号
24. 警惕“现代化”的陷阱－－《文化、权力与》读后
《开放时代》1998年10月号
25. 踟蹰于传统与现代之间
《开放时代》1999年12月号
26. 理想与现实的捍格－－读《：知识分子与中国》
《开放时代》2000年9月号
27. 历史档案中的“毛时代”
《二十一世纪》（中文），即将发表
28. 一个西方社会学家眼中的红卫兵运动
《二十一世纪》（中文），2011年4月号
29. 对历史的另类诠释
《二十一世纪》（中文）2000年8月号
30. 自由主义政治观念的进化
《二十一世纪》（中文）2002年4月号
31. 坚守我们的精神家园
《二十一世纪》（中文）2002年8月号
32. 一个神话的诞生与破灭
《二十一世纪》（中文）2003年4月号
33. 何谓“大历史”、“小历史”和“西方”、“本土”之分野？
《二十一世纪》（中文）2003年6月号
34. 寻访“延安道路”的遗迹
《二十一世纪》（中文）2004年2月号
35. 令人着迷、令人困惑的“主义”
《二十一世纪》（中文）2004年六月号
36. 知识分子改造的歧路
《二十一世纪》（中文）2005年4月号
37. “边缘知识分子”的桥梁作用
《二十一世纪》（中文）2006年十月号
38. 一代者的心理肖像
《二十一世纪》（中文）2008年6月号
39. 道德原则下的囚徒困境
《二十一世纪》，2010年4月号
40. 思想的印迹－－南京李良玉教授《思想启蒙与文化重建》评介
《广西师范学报》2002年第3期
41. 杨时展教授和他的“万言书”
《书屋》，2010年12月号
42. 自由主义的底蕴及其他
《书屋》2004年第1期
43. “王实味现象”解析
《书屋》2004年第3期
44. 性丑闻与社会公众的反应
《书屋》2004年第5期
45. 一个美国人的观
《书屋》2004年第10期
46. 张鸣：游走于戏说历史与文化批判之间
《书屋》2006年第4期
47. 现代困惑与乡村悲情
《书屋》2007年第6期
48. 谁是国难会议的首倡者
《书屋》2008年第10期
49. 张春桥宦海沉浮与“”悖论
《书屋》2009年第2期
50. 王申酉：一个以身殉道的先知
《现代人文评论》2004年第8期
51. 论“五四”时期陈独秀的自由主义观念
《陈独秀研究文集》，中国文史出版社，2005
52. 解构温铁的“三农”问题研究
《大国》第五期（2005年10月出版）
53. 异邦的想象与想象的异邦
《中国书评》第3辑，2006
54. 戴著思想的枷锁翩翩起舞
《红岩春秋》2008年第1期
55. 1966年夏：南京“六二”的来龙去脉
《者》（）总第9期，2006
56. 学界红卫兵运动研究述评
《二十一世纪》（中文）网络版2006年5月号
57. 从南京“倒匡”看“”的复杂属性与多重面相
《二十一世纪》（中文）网络版2006年9月号
58. 江苏“一·二六夺权”前后的权力角逐
《二十一世纪》（中文）网络版2007年6月号
59. 1967年夏天南京“倒许”风潮的台前幕后
《二十一世纪》（中文）网络版2006年11月号
60. 从南京“清队”运动看“”主要的转化
《二十一世纪》（中文）网络版2008年1月号
61. 1976，南京全城排查匿名信
《的生活》2006年第5期
62. 1967年南京“一·三”浅析
《记忆》，第67期，2011年1月30日
63. 阶级关系的解构与重建
《记忆》，第60期，2010年10月20日
64. ？还是帝王政治的回光返照？
《当代中国研究》（美国普林斯顿当代中国研究所）2009年秋季号